【天璋院：てんしょういん】
・異能学園研究都市を創立した二大家の片割れ
・聖園異能学園の理事長を担い、学園という組織を管理している
【玉泉院：ぎょくせんいん】
・異能学園研究都市を創立した二大家の片割れ
・新明異能研究協会の協会長を担い、研究機関の体制を管理している

【聖園異能学園：みその】
・異能学園研究都市の主要施設の一つ
・異能の研究と並行に、異能者を健やかに育てる教育機関
・初等部、中等部、高等部、大学部の十六年間が就学期間
・高等部でも卒業できるが、異能学研都市で生活するには悪手の道
・犯罪研究組織から、幼い異能者を護るための措置もある
・制服は白基調のブレザーに黒基調のズボンとスカートだが、アレンジを加えてもいい
・各学部に一人の学生を象徴に据え、生徒が作る派閥への抑止力を担わせる
・異能者が人類社会の頂点に立つ思想を持つ異能者絶対派、共存派、中立派の派閥がある
・学級編成は40組まであり、一組につき250人程度
・自由性があり、染髪、薄化粧、カラコンなど、ある程度のことは許される
・アクセサリーの盗難は無視され、厚化粧や香水、制服の改造は許されない
・天璋院家の当主が理事長を務め、学園長は天璋院家の当主補佐が担う

【新明異能研究学会：しんめい】
・異能学園研究都市の主要施設の一つ
・異能力の研究を行い、異能力の謎を解明する研究機関
・神部、自然部、呪術部、心理部、変形部、無部の六大部門で構成されている
・異能力の典型で研究対象が一番多い部門は変形部、次に無部、心理部、呪術部、自然部
・神部、召喚部は希少性の高い異能力で、研究対象が最少ため、構成員の人数は少ない
・研究とはいえ、人体実験は禁忌とされ、これを犯した研究員は極刑となる
・遺伝子工学によるクローンを生み出したことがあるが、禁忌に触れて闇に葬られた
・玉泉院家の当主が協会長を務め、各部門の会長は協会長が任命する

【異能特務管理局】
・異能学園研究都市に住む異能者を管理する組織
・異能犯罪の取り締まりの他に、異能学研都市の安全を保安する仕事が主要
・異能による罪を犯す異能者を捕縛し、専用の地下牢に投獄する
・都市内に潜む犯罪組織は特殊精鋭部隊が対応する
『特殊精鋭部隊ハウンド』
・少数精鋭の特殊部隊で、主に凶悪異能犯罪者、異能犯罪組織の鎮圧を請け負う
・一班につき五人前後で、戦闘員、支援員、鑑識官で構成される
・第一〜四班まであり、それぞれに戦闘の心得がある鑑識官が配属され、情報課と連携をとる

【ジェネシス】
・異能学園研究都市に潜む犯罪研究組織
・ほとんどが異能者で構成されているが、無能力者な犯罪研究者も勧誘している
・異能者を非人道的な人体実験を行い、異能力の真理を追い求める
・【世界の根源】に繋がる異能力を探し求め、異能者だけの新たな世界を創造しようと企んでいる